امروزه از بناي موسوم به مدرسه امير شاه ملك اثري بر جاي نمانده است . اما به اعتقاد برخي از محققان از جمله گلبمك اين بنا در ضلع جنوبي مجموعه وجود داشته و در حال حاضر ساختمان جديد جايگزين آن شده است .
اين پژوهشگر كه تحقيق خود را درباره دوره هاي ساختماني مزار شيخ جام انتشار داده است با تكيه بر متن كتاب مقامات بنيان اين مدرسه را 846 ه ق ذكر مي كند . گوياباني آن امير شاه ملك درسال 829 ه ق وفات نموده است . بنابراين نام قيد شده در اين كتاب امير شاه ملك يكي از امراي كلان و معتبر تيمور گوركان بوده است كه نامش دركتيبه مسجد شاه در مشهد ديده مي شود .
وي در اغلب لشكركشيها و جنگبهاي مهم تيمور را همراهي مي كرد و زماني سرپرستي الغ بيك فرزند شاهرخ را به عهده داشت ، بعدها حكمران خوارزم گرديد و تا آخر عمر ( 829 ق) در آن قسمت باقي بود.
برنارد اكين نيز به تأثير ازگزارش گلمبك ، تاريخ بنيان بنا را 846 ه ق مي داند و به اين نكته اشاره دارد ،‌نقشه اي كه توسط ( مك كول) در سال 1938 ميلادي ترسيم شده و توسط دونالد ويلبر انتشار يافته ، ايوان محصور شده اي با يكسري طاقنماها در مجاورت مدرسه فيروزشاهي نشان داده است . وي در كتاب خود ( معماري تيموري در خراسان ) به عكس قبل از ويراني بنا كه توسط ( گدارد ) به چاپ رسيده استناد كرده و به ايوان ويران شده در پشت ايوان ورودي مشتمل بريك طاق ضربي سه كنج كه احتمالاَ داراي تزئينات كاشي كاري بوده اشاره مي نمايد.
در حال حاضر در محل بناي امير شاه ملك مدرسه اي قرار دارد كه طلاب علوم ديني درآن مشغول به تحصيل مي باشند.